「統計学関連なんでもあり」の過去ログ---026

★ 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません） ★

746.　2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　sakamoto　2003/10/07 (火) 15:03
└747.　Re: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　青木繁伸　2003/10/07 (火) 15:18
　└748.　Re^2: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　sakamoto　2003/10/07 (火) 15:30
　　└751.　Re^3: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　青木繁伸　2003/10/07 (火) 16:21

746.　2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　sakamoto　　2003/10/07 (火) 15:03

初歩的なことですみません。自分で検定を行ったのですが，これでよいでしょうか？また，その他の分析方法や応用が有りましたら是非教えてください。
基礎疾患が有る群＝A群
基礎疾患が無い群＝B群
でその患者の主訴が
反復する腹痛
反復する腹痛＋悪心，嘔吐
反復する腹痛＋胸痛
として

　　　反復する腹痛　反復する腹痛＋悪心，嘔吐　反復する腹痛＋胸痛 A群　　　5　　　　　　　　　　2　　　　　　　　　　　0 B群　　 35 　　 7　　　　　　　　　　　1
という人数の分割表で，検定を行いたいのですが，5以下のセルが有るため反復する腹痛と反復する腹痛＋悪心，嘔吐，胸痛に統合して2×2分割表でフィッシャーの正確確率を行ったのは誤りでしょうか？
もっと適切な検定があるのでしょうか。また3要因でも分析しても良いのでしょうか。また要因とその他の要因で3つの表について分析した場合，多重比較の問題がでて，フィッシャーの検定ではどのように修正すればよいのでしょうか。よくわかっていないものですが早急に教えてください。

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747.　Re: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　青木繁伸　　2003/10/07 (火) 15:18

> もっと適切な検定があるのでしょうか。

2×2以外の一般の分割表においても，Fisher's exact test を行うことができます。

http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/exact/exact.html

R には fisher.test があります。
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/Cross/extended-fisher-r.html

> また要因とその他の要因で3つの表について分析した場合，多重比較の問題がでて，フィッシャーの検定ではどのように修正すればよいのでしょうか。

ボンフェローニ法を使えばいいでしょう。

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748.　Re^2: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　sakamoto　　2003/10/07 (火) 15:30

> > もっと適切な検定があるのでしょうか。
>
> 2×2以外の一般の分割表においても，Fisher's exact test を行うことができます。
>
> http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/exact/exact.html
早々ありがとうございました。フィッシャーの正確確率でよいということですね。ところで，順序尺度でなくてもMann-WhitneyやKruskal-Wallis検定を行っても良いと言うことですか？めんどくさい質問ですみません。

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751.　Re^3: 2群計数データーの解析について（初歩的なことですみません）　青木繁伸　　2003/10/07 (火) 16:21

> フィッシャーの正確確率でよいということですね。

念のため。私の言ったのは，2×3の分割表を2×2に併合してフィッシャーの正確確率検定を適用するのではなくて，2×3のまま「拡張したフィッシャーの正確確率検定」を行うのですよと言うことです。

> ところで，順序尺度でなくてもMann-WhitneyやKruskal-Wallis検定を行っても良いと言うことですか？

これも，そうではありませんよ。
紹介したページにはいろいろな exact test を紹介してありますが，sakamoto さんの場合のは，その一番上の
Fisher's exact test (Extended)
です。

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