「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 043

No.11835　多群・他項目の比率の検定　　【パイナップル】　2010/01/26(Tue) 12:51

フィッシャーの正確確率検定の多群・他項目版の検定をしたいのですが，どの手法を使ったらよいか，教えてください。

動物がとる，場所ごと（6種類）の採食行動（5パターン）に違いがあるかを調べています。

・場所1では20回観察できて内訳は，A型採食：3回，B型採食0回，C型採食17回
・場所2では15回観察できて内訳は，A型採食：2回，B型採食1回，C型採食12回
・場所3では19回観察できて内訳は，A型採食：0回，B型2回・・・
という形のデータで，知りたいのは，場所ごとに差があるか？ということです。それぞれの採食型の間の関係は独立です。

場所ごとに観察回数（n）がどうしても異なってしまうため，比率の検定ではないかと思っています。また，マイナーな行動があるため，ゼロ偏りのデータになっていて，χ2検定を使ってはならないと判断しました。

過去のログもいくつか探してみたのですが，しっくり合うものが見つけられませんでした。お手数おかけしますが，どうぞよろしくお願いします。

No.11836　Re: 多群・他項目の比率の検定　　【青木繁伸】　2010/01/26(Tue) 13:14

「採食型の間の関係は独立」というのがどういうことかよくわからないのですけど。
これまた「多群・他項目版の検定」というのがわかりませんけど，Fisher exact test でしょう。R の fisher.test は，2×2分割表より大きい場合にも対応していますよ。群ごとの分布の差の検定は，群と項目の独立性の検定と同じですよ。
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/Cross/differenceofdist.html

もしかして，分布の差の多重比較をしたいということでしょうか？そう言う場合には，R の pairwise.prop.test を改変した，以下のプログラムはどうでしょう。
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/p_multi_comp2.html

No.11848　Re: 多群・他項目の比率の検定　　【パイナップル】　2010/01/26(Tue) 17:20

早速のご回答ありがとうございます。

質問の書き方が悪くすみません。
分布の差の多重比較で，やりたかった検定ができました。

本当にどうもありがとうございました。