No.06720 Rによる多重比較について  【beidao】 2008/06/09(Mon) 22:06

Rによる多重比較を行おうと考えております。

そこで,http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/のページからソースを拝借しようとしたのですが,平均値の多重比較は2種類紹介されていましてどちらを使うべきなのか迷っております。

【平均値の差の多重比較(ライアンの方法,テューキーの方法)】と【テューキーの方法による対比較 】です
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/Average/Tukey1.html
のプログラム1とプログラム2です。

どのような違いがあるのか教えてください。
(実際に簡単なデータで試したところ片方の方法では有意差がでるのに他方では出ないということがありました)

No.06721 Re: Rによる多重比較について  【青木繁伸】 2008/06/09(Mon) 22:42

http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/m_multi_comp.html の m.multi.comp は,範囲を狭めていって,有意でないところで検定を打ち切る

http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/tukey.html の tukey は,とにかく全部の組み合わせについて検定する

思想の違いと言うことか

No.06723 Re: Rによる多重比較について  【beidao】 2008/06/09(Mon) 23:07

そういうことでしたか
どちらもtukeyということで混乱していたのですが,検定の進め方に違いがあったわけですね
的確な返答ありがとうございました。

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