No.06265 ROC curveの比較  【rx811】 2008/04/03(Thu) 22:10

ROC curve同士の比較の仕方を教えて欲しいのですが,AUCを比較するのはC statisticでよいのですか?よく分からず困ってます。
また,C statistic解析ができる統計解析ソフトはありますか?SPSSではできません。ぜひ教えて頂きたいです。

No.06266 Re: ROC curveの比較  【青木繁伸】 2008/04/03(Thu) 22:46

C Statistic(C統計)って何なのでしょう。ググってもたいしたものは出てきません。
C index と同じものなのでしょうか。また,C index は AUC と同じものなのでしょうか?

http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/mb-arc/arc025/541.html

計算方法も簡単なものなのですが,何を解析するというのでしょう?

http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/ROC.html

No.06267 Re: ROC curveの比較  【青木繁伸】 2008/04/04(Fri) 12:46

SPSS ROC の二語でググったら,たくさん出てきますが,
SPSS FAQ
修 正パッチ(バージョン10.1.4)がSPSS社の公式ホームページからダウンロードできる. ..... 度数 記述統計 探索的分析 ROC曲線 クロス集計 要約レポート 平均の比較t検定 一元配置分散分析と事後検定 単純因子ANOVA(含む共分散分析) ...
http://web.kanazawa-u.ac.jp/~tokada/spss/spssa.htm - 18k - キャッシュ - 関連ページ
Base でできるって,書いてありますよ。
(古いバージョンでは「分析」の下じゃなくて,「グラフ」の下だそうです。)

No.06274 Re: ROC curveの比較  【こやまたつき】 2008/04/04(Fri) 22:57

AUC の比較に C statistic が使えますが,シンプルにできるのは(たぶん)独立している場合に限られます.例えば同じデータから複数の prediction models を導いている場合は独立していないので,シンプルな比較は(たぶん)出来ません.その場合,DeLong, DeLong, Clarke-Pearson (1988 Biometrics) の手法が使われます.SAS の %ROC macro でも http://mayoresearch.mayo.edu/mayo/research/biostat/splusfunctions.cfm にある Splus, R の function でも計算できます.でも一般的に ROC 関連の解析が最も充実しているのは STATA のようです.

た だ DeLong et al の手法はどうやらパワーが低いようで,最近 Pencina, D'Agostino, D'Agostino, Vasan (2008 Stat Med) に新しい手法が発表されました.そのうち R の Hmisc Library に組み込まれるんじゃないでしょうか?

No.06275 Re: ROC curveの比較  【こやまたつき】 2008/04/05(Sat) 04:15

つけたし:
でも ROC curve って大した情報含んでないですね.

No.06279 Re: ROC curveの比較  【rx811】 2008/04/05(Sat) 13:03

お二人とも有難うございました。
SAS,STATA,S-PLUS,Rなどの統計解析ソフトをネットでチラッと見ましたが,どれを選べばよいのかはっきり言ってよく分からないですねー。
私は医療の疫学研究で使用する程度で,統計は必要な領域を独学で勉強しているに過ぎません。
統計をされている他の先生などの意見も聞いて考えようと思います。
もし,統計ソフトの良し悪しでアドバイスがありましたら教えて下さい。

No.06285 Re: ROC curveの比較  【青木繁伸】 2008/04/05(Sat) 21:47

> SAS,STATA,S-PLUS,Rなどの統計解析ソフトをネットでチラッと見ましたが,どれを選べばよいのかはっきり言ってよく分からないですねー。

外的な信頼性から言えば (SAS, STATA) > S-PLUS > R かな
コストパフォーマンスから言えば R。なんたってコストは0なので,コストパフォーマンスは∞(=パフォーマンス/0)。
R なら,用意されていない分析方法についてでも,自分でプログラム(関数)を書けばよい(これは,他のものでも要件を満たすものはあるが)。

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