「統計学関連なんでもあり」の過去ログ---035

★ one way ANOVAのpairwise differences？ ★

7820.　one way ANOVAのpairwise differences？　meta　2005/10/04 (火) 22:54
└7822.　Re: one way ANOVAのpairwise differences？　青木繁伸　2005/10/04 (火) 23:32

7820.　one way ANOVAのpairwise differences？　meta　　2005/10/04 (火) 22:54

進化遺伝学のpaperなどでたびたび見かける「pairwise　difference」とはどういった解析手法なのでしょうか。ゲノムのアライメントによる多型サイトをペア間比較することで山なりのグラフができるようですが，具体的にどのようにしてグラフが描けるのか分かりません。純粋な統計学とは異なる話題ですが，もしお分かりの方がいらっしゃいましたら，よろしくお願いします。

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7822.　Re: one way ANOVAのpairwise differences？　青木繁伸　　2005/10/04 (火) 23:32

どんなグラフなんでしょうね。例が載っている URL なんかないのですか。

単に，pairwise difference を検索すると，おっしゃっているないように近いのではないかと思われるページがありました。

http://www.statsdirect.com/help/data_preparation/pairwise_diff.htm

R で計算すると

> x <- c(1,2,3)
> y <- c(2,3,6)
> outer(x, y, "-")
[,1] [,2] [,3]
[1,] -1 -2 -5
[2,] 0 -1 -4
[3,] 1 0 -3

みたいな計算ですね。
正規分布するデータ10個ずつでシミュレーションしてみると
> x <- rnorm(10)
> y <- rnorm(10)
> hist(outer(x, y, "-"))
により，
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/mb-arc/pairwise-differences.png みたいなヒストグラムになります。

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