SEM

pathDiagram　　　　　Last modified: Jan 01, 2012

pathDiagram は，sem の結果からグラフ描画プログラム（dot）でパス・ダイアグラムを描く。dot は http://www.graphviz.org/ を参照。

使用法

pathDiagram(model, file, min.rank = NULL, max.rank = NULL,
	same.rank = NULL, variables = model$var.names, parameters = rownames(model$ram),
	ignore.double = TRUE, edge.labels = c("names", "values", "both"), 
	size = c(8, 8), node.font = c("Helvetica", 14),
	edge.font = c("Helvetica", 10), rank.direction = c("LR", "TB"), 
	digits = 2, standardize = FALSE, output.type=c("graphics", "dot"),
	graphics.fmt="pdf", dot.options=NULL, ...)

R.DHP <- readMoments(diag=FALSE, names=c('ROccAsp', 'REdAsp', 'FOccAsp', 
                'FEdAsp', 'RParAsp', 'RIQ', 'RSES', 'FSES', 'FIQ', 'FParAsp'))
    .6247                                                              
    .3269  .3669                                                        
    .4216  .3275  .6404                                      
    .2137  .2742  .1124  .0839                                
    .4105  .4043  .2903  .2598  .1839                          
    .3240  .4047  .3054  .2786  .0489  .2220                    
    .2930  .2407  .4105  .3607  .0186  .1861  .2707              
    .2995  .2863  .5191  .5007  .0782  .3355  .2302  .2950        
    .0760  .0702  .2784  .1988  .1147  .1021  .0931 -.0438  .2087  

model.dhp <- specifyModel()
    RParAsp  -> RGenAsp, gam11,  NA
    RIQ      -> RGenAsp, gam12,  NA
    RSES     -> RGenAsp, gam13,  NA
    FSES     -> RGenAsp, gam14,  NA
    RSES     -> FGenAsp, gam23,  NA
    FSES     -> FGenAsp, gam24,  NA
    FIQ      -> FGenAsp, gam25,  NA
    FParAsp  -> FGenAsp, gam26,  NA
    FGenAsp  -> RGenAsp, beta12, NA
    RGenAsp  -> FGenAsp, beta21, NA
    RGenAsp  -> ROccAsp,  NA,       1
    RGenAsp  -> REdAsp,  lam21,  NA
    FGenAsp  -> FOccAsp,  NA,       1
    FGenAsp  -> FEdAsp,  lam42,  NA
    RGenAsp <-> RGenAsp, ps11,   NA
    FGenAsp <-> FGenAsp, ps22,   NA
    RGenAsp <-> FGenAsp, ps12,   NA
    ROccAsp <-> ROccAsp, theta1, NA
    REdAsp  <-> REdAsp,  theta2, NA
    FOccAsp <-> FOccAsp, theta3, NA
    FEdAsp  <-> FEdAsp,  theta4, NA

sem.dhp <- sem(model.dhp, R.DHP, 329,
    fixed.x=c('RParAsp', 'RIQ', 'RSES', 'FSES', 'FIQ', 'FParAsp'))
    
pathDiagram(sem.dhp, "example1")

引数

model sem オブジェクト
... pathDiagram.sem に引き渡されるその他の引数
file ドット記述ファイルとモデルのグラフのファイル名（拡張子を除く）。指定されないとドット記述ファイルだけがコンソールに出力される。
min.rank 最低位に置かれる変数のリストをカンマで区切った文字列

max.rank 最高位に置かれる変数のリストをカンマで区切った文字列 pathDiagram(sem.dhp, "example2", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FParAsp, FSES, FIQ', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp')

same.rank 同順位に置かれる変数のリストをカンマで区切った文字列 pathDiagram(sem.dhp, "example3", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FSES', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', same.rank='FParAsp, FIQ')

variables グラフに描かれる変数名（デフォルトはモデルにおける変数名）
parameters パラメータ名（デフォルトはモデルにおけるパラメータ名） pathDiagram(sem.dhp, "example4", variables=LETTERS[1:12], parameters=letters[1:14])

ignore.double デフォルト（TRUE）では，分散・共分散を表す両方向矢印を描かない。 pathDiagram(sem.dhp, "example5", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FSES', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', same.rank='FParAsp, FIQ', ignore.double=FALSE)

edge.labels 矢印のそばに描かれるもの。"names" はパラメータ名，"values" はパラメータの推定値，"both" なら両方 pathDiagram(sem.dhp, "example6", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FSES', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', same.rank='FParAsp, FIQ', edge.labels="both")

size グラフの大きさ（単位はインチ）
node.font 変数名を描くフォントの名前とポイント数

edge.font 矢印のそばに描かれる名前・値のフォントの名前とポイント数 pathDiagram(sem.dhp, "example7", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FSES', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', same.rank='FParAsp, FIQ', node.font=c("Osaka", 16), edge.font=c("Times", 16), edge.labels="value")

rank.direction グラフの方向。"LR" なら左から右へ，上から下なら "TB" pathDiagram(sem.dhp, "example8", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FParAsp, FSES, FIQ', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', rank.direction="TB")

digits パラメータの推定値を表記するときの，小数点以下の桁数

standardize TRUE のとき標準化係数を表示する。デフォルトは FALSE pathDiagram(sem.dhp, "example9", min.rank='RIQ, RSES, RParAsp, FParAsp, FSES, FIQ', max.rank='ROccAsp, REdAsp, FEdAsp, FOccAsp', edge.labels="value", digits=5, standardize=TRUE)

output.type "graphics"（デフォルト）のとき, ".dot" ファイルとグラフィックファイルの両方を生成する。"dot" のときは ".dot" ファイルのみを生成する。
graphics.fmt グラフィックファイルのフォーマット（拡張子）。デフォルトは "pdf"。
dot.options dot プログラムへの引数（文字列で指定）

直前のページへ戻る　　 E-mail to Shigenobu AOKI