No.21958　Rパッケージ　　【赤岳】　2016/04/01(Fri) 14:54

いつもお世話になっています。
このサイトでRのバグを聞くのはお門違いとは思いますが，ご容赦ください。
MCMCpackをインストールしたいのですが，「graphが利用できない」とか，「MCMCregressを見つけられない」といったメッセージが出て，うまく動きません。
どなたか解決方法を教えていただけませんでしょうか。
使用のR Versionは，R version 3.2.4 Revisedです。
OSは，Windows7です。

> install.packages("MCMCpack")
警告: 依存対象 (dependency) ‘graph’, ‘Rgraphviz’ が利用できません
URL 'https://cran.ism.ac.jp/bin/windows/contrib/3.2/MCMCpack_1.3-5.zip' を試しています
Content type 'application/zip' length 3014557 bytes (2.9 MB)
downloaded 2.9 MB
パッケージ ‘MCMCpack’ は無事に展開され，MD5 サムもチェックされました
ダウンロードされたパッケージは，以下にあります
C:\Users\・（省略）・・\downloaded_packages
> library(MCMCpack)
Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) :
‘graph’ という名前のパッケージはありません
エラー: ‘MCMCpack’ に対するパッケージもしくは名前空間のロードが失敗しました

> y <- c(1,3,3,3,5)
> x1 <- c(1,2,3,5,5)
> x2 <- c(2,3,1,5,2)
> x <- matrix(c(x1,x2),ncol=2,nrow=5)
>
> result3.sim <- MCMCregress(y~x, data = parent.frame(), burnin = 1000, mcmc = 10000)
エラー: 関数 "MCMCregress" を見つけることができません

よろしくお願いします。
No.21962　Re: Rパッケージ　　【鈴木康弘】　2016/04/03(Sun) 08:37

　MCMCpackなるものは知らないのですが，エラーメッセージからすると，Rgraphvizというパッケージも必要みたいですね。

http://d.hatena.ne.jp/Tanakky/20070727

などを見ると，そのパッケージインストールも一筋縄ではいかないみたい？
No.21964　Re: Rパッケージ　　【赤岳】　2016/04/03(Sun) 12:34

鈴木先生
レスいただきありがとうございます。
CRANを探してみましたが，見当たらず，下記の文章がありました。
Package ‘Rgraphviz’ was removed from the CRAN repository.
まだ，解決していませんが，取り急ぎお礼申し上げます。
No.21968　Re: Rパッケージ　　【青木繁伸】　2016/04/04(Mon) 18:49

解決するかどうかはわからないし，古い記事もあるのだけれど，
「Rgraphviz インストール」で検索すると，たくさん出てきますけど
（ちなみに，Mac だと，何の問題もなく動くようだが？？）
No.21969　Re: Rパッケージ　　【赤岳】　2016/04/05(Tue) 12:54

青木先生，鈴木先生
できました！
ありがとうございます。
「Rgraphvizインストール」で検索し，
source("http://bioconductor.org/biocLite.R");biocLite("Rgraphviz")
でインストールできました。
また，MCMCpackも下記のようにバグることなく動きました。
ほんとうに感謝します。ありがとうございました。

> library(MCMCpack)
##
## Markov Chain Monte Carlo Package (MCMCpack)
## Copyright (C) 2003-2016 Andrew D. Martin, Kevin M. Quinn, and Jong Hee Park
##
## Support provided by the U.S. National Science Foundation
## (Grants SES-0350646 and SES-0350613)

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