「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 047

No.21586　分かりません。　　【素人】　2015/03/06(Fri) 11:34

青木先生，2日前にさせていただいた質問の続きです。以下の内容について，教えていただけると幸いです。よろしくお願い致します。

　　　　　　　　　　　　　　　A疾患
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　　　　　　　異常あり（N=15）　 異常なし（N=24)　　P値
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 発症年齢(SD)　　66.7(9.8）　　　 63.2(8.9）　     .48
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 診断年齢(SD)    70.3(9.5)        67.6(8.2)        .46
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論文中にMann-Whitney rank sum testによってP値を算出したと書かれていますが，これはウィルコクソンの順位和検定と同じことでしょうか？

　　　　　　　　　　　　　　　　　　A疾患
-----------------------------------------------------------------------
Characteristic　　　異常あり（N=216）　 異常なし（N=12)　　P値
-----------------------------------------------------------------------
Female(%）　　　　　　　55.1　　　　　　　41.7　　　　　  .54
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Left-handed(%)    　　　 5.6               8.3            .81
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この統計手法は，2×2集計表で性別あるいは利き手と異常の有無の独立性の検定という解釈でよろしいでしょうか？

　　　　　　　　　　　　　　　　　薬の有効性 No/Total No(%）
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Drug Sample Size　悪化　　不変　　部分寛解　　寛解　　部分寛解＋寛解　　P値
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A　　     17 　　　0    1/17(5.9）7/17(41.2）9/17(52.9）16/17(94.1）  .04 vs C
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B    　　 16       0    1/16(6.3）8/16(50.0）7/16(43.8）15/16(93.8） .046 vs C
--------------------------------------------------------------------------------
C          6　　　 0    3/6(50.0）2/6(33.3） 1/6(16.7）  3/6(50.0）   .04 vs A
                                                                     .046 vs B
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D          9       0    2/9(22.2）6/9(66.7） 1/9(11.1）  7/9(77.8）   .33 vs C
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論文中に統計手法として，Fisher exact test for each pairwise comparison of total responder ratioを使用したと記載されていますが，主にCと他薬の一対比較をフィッシャーの正確検定を使ってP値を算出したという解釈でよろしいでしょうか？

初歩的な3つの質問で申し訳ありませんが，何卒よろしくお願い致します。

No.21587　Re: 分かりません。　　【青木繁伸】　2015/03/06(Fri) 15:37

1) 「Mann-Whitney rank sum test」　=　「ウィルコクソンの順位和検定」
「Mann-Whitney rank sum test」は普通は，「Mann-Whitney test」と呼ばれる。

2) 2×2集計表で性別あるいは利き手と異常の有無の独立性の検定という解釈
元データは以下のように計算可能なので，
           +     -
Female   119     5
Male      97     7
これについて独立性の検定（カイ二乗検定）をやると，Chi-sq.=0.3735, p-value=0.5411 になるのだから，そうなのでしょう。
なお，Left-handed については
           +    -
yes       12    1
no       204   11
なので，Chi-sq=0, p-value=1 となるはずのところを，連続性の修正に伴う計算のミス（プログラムミス）により p=0.81 となっている（R 2.15.0 以前もプログラムミスのため p=0.81 となっていた）。

3) 主にCと他薬の一対比較をフィッシャーの正確検定を使ってP値を算出したという解釈

でしょうね。全ての組合せについての 6 通りの検定結果は以下の通り。
A B 1 
A C 0.04009034 
A D 0.2676923 
B C 0.04579631 
B D 0.5304348 
C D 0.3286713 

No.21589　Re: 分かりません。　　【素人】　2015/03/06(Fri) 20:43

青木先生，ありがとうございました。ご丁寧に教えていただき，感謝申し上げます。

No.21592　Re: 分かりません。　　【青木繁伸】　2015/03/19(Thu) 21:08

> 2日前にさせていただいた質問の続きです。

前の質問，消去したのですか。
後で読む人のためにも，消去などすべきではないです。