「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 045

No.16963　きわめて少数例で有意を検討できるのかについて　　【HK】　2012/05/26(Sat) 10:35

No. 16960の酒井氏の質問と青木先生のNo. 16962でのお答えについてなのですが，それでも納得行きません。
Fisher_exactで小さいp値が出たのは，非介入群が多かったからではないでしょうか？
fisher.test(matrix(c(3,0,7,41),2))
の場合は，p = 0.00576
非介入群のサンプルサイズを10にすると，その中で有効はやはり0件なので，
fisher.test(matrix(c(3,0,7,10),2))
となり，
p = 0.2105が得られます。これだと有意でないのですよね。

介入群と非介入群が異なるサンプルサイズでも良いのかも知れませんが，非介入群を増やすだけで，p値を小さくできるのは，科学的に意味のあるp値であるとは思えません。
検定とは，そんなものだと言うことでしょうか？それとも私の誤解でしょうか。

No.16964　Re: きわめて少数例で有意を検討できるのかについて　　【ひの】　2012/05/26(Sat) 12:32

誤解というより単なる言いがかりだね。

No.16965　Re: きわめて少数例で有意を検討できるのかについて　　【HK】　2012/05/26(Sat) 16:36

ひの様，

私は，基礎の生物研究者（のようなもの）ですが，自身や大学院学生の実験で，サンプルサイズの取扱いにどうしてよいのか迷っているものです。そして，このようなケースは，例えば，論文の査読のような状況ででくわすことが多いのです。私が，そのような論文を査読する機会があれば，No.16963で書いたようなことを，コメントしてしまいそうです。
言いがかりではなく，冷やかしでもないので，もう少し詳しく解説していただけますか。

この場合，介入群が10件しかなくとも，非介入群が42件あり，有効の判定が0件であるからよいのだと考えると言うのでしょうか。

No.16966　Re: きわめて少数例で有意を検討できるのかについて　　【青木繁伸】　2012/05/26(Sat) 16:49

データがどのように採られたかというのにもよるでしょう。実際的に最大限これだけしか採れなかったということなら，介入群をもっと採るべきということも言えないし，非介入群の一部を捨てろとも言えないでしょう。また，横断的に採られた後に群を分類して検定するというような場合に，2群のサンプルサイズがアンバランスになるのは避けられない。

> Fisher_exactで小さいp値が出たのは，非介入群が多かったからではないでしょうか？

恣意的なデータサンプリングがなければ，介入群の有効率の精度は低いが介入群の有効率が0であるという方の精度は高い，そしてその状況下で統計学的に有意な差があるといえたのだから，別に差し支えないでしょう。

No.16968　Re: きわめて少数例で有意を検討できるのかについて　　【HK】　2012/05/27(Sun) 07:19

青木先生，了解いたしました。
この場合，非介入を評価するということと理解しました。
ありがとうございます。
ひの様，私の発言にちょっととげがあったかもしれません。お許しください。