「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 044

No.14332　Rにおけるメモリについて　　【あつ】　2011/02/16(Wed) 15:27

信号処理の研究を行っている者です。
大量のデータをRで扱うことが多く，メモリ不足にいつも悩まされています。
メモリに関していくつか質問させてください。

まず環境ですが，
PCはWindows Xp，物理メモリ 2GB，R のバージョンは 2.11.1，
Rを起動する際に --max-mem-size=2047M をつけています。
data：縦200万 × 横24 の行列に対して k_means=kmeans(data, 2, nstart=1) を実行すると，サイズ 369.1Mbのベクトルを割り当てることができませんと出ます。ただこのときコミットチャージを見ると，使用量は 1400MB 程度でした。369.1Mbのベクトルもまだ割り当てられるように思えるのですが，何か理由があるのでしょうか？

また，メモリエラーを回避するテクニックとして調べてみましたところ，
○ こまめに rm() で開放して gc() 2回
○ 永続付値による関数への値の参照渡し
などがありましたが，これら以外に有効な方法（例えば仮想メモリを使えるようにするなど）はありますでしょうか？

ご教授いただければ幸いです。よろしくお願いいたします。