「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 042

No.08262　クラスター分析　　【uni】　2008/11/16(Sun) 14:06

別のソフトでユークリッド距離を求め，test1.txtに保存し，Rに読み込みました。
そのデータをもとに最遠隣法でクラスター分析を行うにはどのようにすれば良いのでしょうか？

> test1-hc <- hclust(test1)
以下にエラーif (n < 2) stop("must have n >= 2 objects to cluster") :
引数の長さが0です

という表示が出てしまいます。

No.08265　Re: クラスター分析　　【青木繁伸】　2008/11/16(Sun) 16:20

なぜ，別のソフトでユークリッド距離を計算するのでしょうか？
Rのdist関数が返すオブジェクトは"dist"クラスであることはご存じでしょうか？
単に距離行列を読み込んだら"matrix"クラスになっているのではないですか？
エラーメッセージはそのようなことを表しています（ストレートではないけど）
読み込んだ距離行列をxとすれば，hclust(as.dist(x))とすれば動くんじゃないでしょうか。。。

No.08268　Re: クラスター分析　　【uni】　2008/11/17(Mon) 00:08

ありがとうございます！
無事解決しました。
slide window techniqueを使ってユークリッド距離を求めたかったので，C言語を使って距離行列を求めたんです(><)