「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 039

No.00805　2指標の検定　　【さくら】　2006/08/01(Tue) 15:26

初心者です。よろしくお願いいたします。データを添付させていただきましたが，ある2つの遺伝子座M1,M2における遺伝子型（AA，AB)があり，それぞれの遺伝子型における腎炎の重症度指数を以下に示しました。この際，M1遺伝子座での遺伝子型AA,ABにおける重症度の違いが，M2遺伝子座のAAにより縮小したかの検定は可能でしょうか。

　M1遺伝子座　　個体数　平均腎炎指数（SD)　
　遺伝子型（AA）　 17　　　　2.1（1.1）
　遺伝子型（AB) 　 22 3.2 (1.7)

M1遺伝子座　　 M2遺伝子座個体数　平均腎炎指数（SD)　
　遺伝子型（AA）　遺伝子型（AA） 9　　　　2.4（1.2）
　遺伝子型（AB) 　遺伝子型（AA） 10 2.8 (1.6)

No.00806　Re: 2指標の検定　　【青木繁伸】　2006/08/01(Tue) 16:19

> 検定は可能でしょうか
との質問ですが，可能でないと判断したのか，可能かどうかわからなかったのかどうなのか。。。

統計学だけで済まない問題のようにお見受けしますが
　M1遺伝子座　 　個体数　 平均腎炎指数（SD)　
　遺伝子型（AA）　 17        2.1（1.1）
　遺伝子型（AB) 　 22        3.2 (1.7)
の方は，M2 は AB なんですか？

M1 の水準 AA, AB と M2 の水準 AA と AB の二元配置分散分析でしょうか？
あるいは，M1:M2 が AA:AB と AA:AA の比較と, AB:AB と AB:AA の比較かな？

No.00807　Re: 2指標の検定　　【さくら】　2006/08/01(Tue) 17:06

説明不足で申し訳ありません。上段はM1遺伝子座のみを規定した場合（M2の規定はありません）と，下段はM1遺伝子座とさらにM2遺伝子座を規定した場合です。M2遺伝子座の遺伝型（AA)はM1での遺伝子型AA,ABの相違に影響を与えているかを検討したいです。M2の要素が加わることにより，上段におけるAAの腎炎指数とABの腎炎指数との差が，縮小しているように見えるのですが。適切な検定にて提示したく思ってます。

No.00808　Re: 2指標の検定　　【青木繁伸】　2006/08/01(Tue) 17:52

> M2の要素が加わることにより，上段におけるAAの腎炎指数とABの腎炎指数との差が，縮小しているように見えるのですが

上の結果が M2 についてなんの情報も持っていないのですから，下の結果をもたらしたのが M2 であるとは言えないのではないですか？

No.00809　Re: 2指標の検定　　【青木繁伸】　2006/08/01(Tue) 17:57

下の結果は上の結果の一部なんですか？

No.00810　Re: 2指標の検定　　【さくら】　2006/08/01(Tue) 18:28

再三のご指摘をいただき，すみません。下の結果は，上の集団内での解析です。つまり上段のM1の集団に，M2の要素を加えた集団において，M2のAAがM1の集団に及ぼした影響を検定したいです。

No.00811　Re: 2指標の検定　　【青木繁伸】　2006/08/01(Tue) 18:47

じゃあ，まず，上の結果から M2 が AA であるものを除いて集計するべきでしょう。
つまり，最初にコメントしたように
M1 M2
AA AA
AA AB
AB AA
AB AB
と整理するべきでしょう。

No.00812　Re: 2指標の検定　　【さくら】　2006/08/01(Tue) 19:11

ご指摘のとおりに提示してみました。以下のとおりですが，M2をAA型にした場合，M1のAA型，AB型における腎炎指数の違いに影響を与えるかを検定したいのですが。。

M1遺伝子型　M2遺伝子型　個体数　平均値（SD)
　AA　　　　　AA　　　　　9　　　2.4（1.2)
　AA 　　　　 AB 8 　1.8 (0.7)
AB AA 10 　2.8 (1.6)
AB AB 12 　 3.6 (1.7)

No.00813　Re: 2指標の検定　　【青木繁伸】　2006/08/01(Tue) 21:39

まとめてみて，どうなりました？
平均値を比べてみて，あるいはその平均値の値は意味のある差，意味のある数値ですか？
あなたの思うような結果が出そうかな？
どうやればそれが分かるのかな？

二元配置分散分析で交互作用が認められればお望みの結果になるのかな？

安易な答えを求めるのは，あんまり好ましいことではないですよ。