No.00490 Rで、  【バッハ】 2006/06/27(Tue) 07:57

初めまして。

非計量MDSでデータ解析をRにてやりたいのですが,プログラム?がわかりません。また,解析する類似性のデータは何かしら変換(相関行列?)して使用しなければならないのでしょうか?
さらに,Rで解析した場合,座標の散布図しか得られないのでしょうか?

No.00491 Re: Rで,  【青木繁伸】 06/06/27(Tue) 13:17

google で,
site:r-project.org nonmetric multi dimensional scaling
として検索すると,labdsv と vegan パッケージが出てくるようですが。
MASS には isoMDS と sammon 関数がある。

No.00495 Re: Rで,  【バッハ】 06/06/28(Wed) 04:21

こんにちは,回答ありがとうございました。

関数は検索して出てきたのですが,動かすると,入れるデータがダメなようで,使えないデータ,と言われてしまいまして・・・。
類似性データをそのまま突っ込んではいけないようなのです。
MDSの計算自体に距離変換も入っているのではないのか??
と言う感じです。

No.00496 Re: Rで,  【青木繁伸】 06/06/28(Wed) 10:15

オンラインヘルプをみて,なおかつ動かないのでしょうか?
オンラインヘルプの最後にある example は
example(関数名)
で実際に動くので,それと貴方がやった操作(データの準備)に問題がないか,比較しましたか?

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