「統計学関連なんでもあり」の過去ログ---036

★ 遺伝子型の推定の検定について ★

8452.　遺伝子型の推定の検定について　メンデル　2005/11/24 (木) 21:31
└8456.　Re: 遺伝子型の推定の検定について　浦城　2005/11/25 (金) 15:06
　└8464.　Re^2: 遺伝子型の推定の検定について　メンデル　2005/11/25 (金) 21:21
　　└8484.　Re^3: 遺伝子型の推定の検定について　浦城　2005/11/28 (月) 13:14

8452.　遺伝子型の推定の検定について　メンデル　　2005/11/24 (木) 21:31

動物のある遺伝病（常染色体劣性遺伝）について，遺伝子型が明らかな個体と不明な個体（発症していない個体）を交配したときに，不明な個体の遺伝子型を推定しようとしています。遺伝子型が判明している個体は発症個体：劣性ホモ（aa）です。交配相手の遺伝子型は不明です。出生数は 4頭で，発症数は0頭でした。交配相手の遺伝子型は非発症個体なので優性ホモ（AA)あるいはヘテロ（Aa)と仮定できます。

1）ヘテロの場合：次世代の遺伝子型はAaとaaで分離比は1：1。4頭中4頭の非発症個体（ヘテロ）が出る確率は(0.5^4=0.0625>0.05なので，ヘテロであるという仮説は棄却できない。

2）優性ホモの場合：次世代の遺伝子型はAaのみ。4頭中0頭の発症個体が出る確率は0。よって優性ホモという仮説は棄却できない。

これらの条件から，遺伝子型を検定することはできないのでしょうか？

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8456.　Re: 遺伝子型の推定の検定について　浦城　　2005/11/25 (金) 15:06

はじめまして

回答になっているのかわかりませんが，条件付確率をもって評価するという方法は如何でしょうか？

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8464.　Re^2: 遺伝子型の推定の検定について　メンデル　　2005/11/25 (金) 21:21

ご返答をありがとうございます。ご指示いただけた方法で試してみようと思います。

関連した質問があります。
常染色体劣性遺伝の場合，オスがヘテロ（Aa)でメスが劣性ホモ（aa）を交配したとき，次世代に発症個体（aa）が4頭中2頭，生まれる時の確率を求める方法を探しています。次世代の遺伝子型はAaとaaで分離比は1：1となります。どのように計算して求めればよいでしょうか？

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8484.　Re^3: 遺伝子型の推定の検定について　浦城　　2005/11/28 (月) 13:14

子の遺伝子型はそれぞれ0.5の確率でヘテロと劣勢ホモになる
4頭のうち2頭だけが劣勢ホモになる確率は0.5^4
どの2頭が劣勢ホモになるかの組み合わせが4C2
これを掛け合わせて3/8
・・・でいいんですかね？

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