「統計学関連なんでもあり」の過去ログ---028

★ association study -Z score ★

2343.　association study -Z score　mm　2004/02/14 (土) 01:08
└2347.　Re: association study -Z score　青木繁伸　2004/02/14 (土) 02:17
　└2348.　Re^2: association study -Z score　mm　2004/02/14 (土) 03:47
　　└2349.　Re^3: association study -Z score　青木繁伸　2004/02/14 (土) 09:43
　　　└2351.　Re^4: association study -Z score　mm　2004/02/14 (土) 10:19

2343.　association study -Z score　mm　　2004/02/14 (土) 01:08

association study を行っている，生物専攻の学生です。
私は，2つの頻度pを比較するときに，Z scoreをもちいて，比較を行っております。
Zをだすときに，p　の　measurement error を補正するため，p のvarianceで補正しています。
しかし，pの測定を2回しか行っておりません。その場合，2回のものからは，分散はないから，varianceは出せないのでしょうか。

あまり，純粋な統計学ではないのですが，アドバイスをお願いします。

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2347.　Re: association study -Z score　青木繁伸　　2004/02/14 (土) 02:17

> pの測定を2回しか行っておりません。その場合，2回のものからは，分散はないから， varianceは出せないのでしょうか。

p は頻度ということですが，具体的にどんな値を取るのかよく分からないのですが，それはさておき，

p の数値は二つあるということですか？
二つあれば分散は計算できますね。
p1，p2 という二つの数値の平均値を pm とすれば，分散の定義式どおり，{(p1-pm)^2+(p2-pm)^2}/2 ですが？？？（不偏分散なら (p1-pm)^2+(p2-pm)^2 です）

> あまり，純粋な統計学ではない

純粋な統計学でないとは，どういうことでしょうか。

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2348.　Re^2: association study -Z score　mm　　2004/02/14 (土) 03:47

ご返答ありがとうございました。

> p は頻度ということですが，具体的にどんな値を取るのかよく分からないのですが，それはさておき，

pは，あるSNPのminor alleleの頻度で，0から0.5の値をとります。2回測ったので，pは2つ出ています。測定誤差がなければ，同じ値をとるはずのものです。

> p の数値は二つあるということですか？
> 二つあれば分散は計算できますね。
> p1，p2 という二つの数値の平均値を pm とすれば，分散の定義式どおり，{(p1-pm)^2+(p2-pm)^2}/2 ですが？？？（不偏分散なら (p1-pm)^2+(p2-pm)^2 です）

はい，値は出ると思います。2つの値しかないのに，ばらつきということを考えていいのかと思いました。
実験において，n＝3以上でなければ，標準偏差をとっても意味がないと教わりました（正しく理解できてなかったのかもしれません）。

> 純粋な統計学でないとは，どういうことでしょうか。
確かに，意味のわからない発言です。失礼いたしました。

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2349.　Re^3: association study -Z score　青木繁伸　　2004/02/14 (土) 09:43

> はい，値は出ると思います。2つの値しかないのに，ばらつきということを考えていいのかと思いました。

一つしかないときにはばらつきは定義できないですね。
二つ以上ならばらつきは定義できます。

> 実験において，n＝3以上でなければ，標準偏差をとっても意味がないと教わりました（正しく理解できてなかったのかもしれません）。

定義できるのと意味があるのの違いです。
あなたが，「二つだからばらつきが出せない」ということだったので，コメントしたわけです。
意味があるかと言うよりは，信頼性の問題でしょう。そういう観点なら，3つであっても，信頼性は低いでしょう。10個でも疑わしいかもしれず。

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2351.　Re^4: association study -Z score　mm　　2004/02/14 (土) 10:19

ご返答ありがとうございました。
値を出すことと，その値にどれだけ意味があるかは，違うことだとわかることができ，よかったです。

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