「統計学関連なんでもあり」の過去ログ---025

★ chi square test trendの適応について ★

299.　chi square test trendの適応について　yoko　2003/07/10 (木) 02:28
└300.　Re: chi square test trendの適応について　青木繁伸　2003/07/10 (木) 09:35
　└307.　Re^2: chi square test trendの適応について　yoko　2003/07/10 (木) 13:36
　　└308.　Re^3: chi square test trendの適応について　青木繁伸　2003/07/10 (木) 14:14

299.　chi square test trendの適応について　yoko　　2003/07/10 (木) 02:28

当院で，血液から分離される特定菌種の数が増加している
のを検討するため，以下のdataについてchi square test trend
を使用しました。
Year 　　　　 1997 1998 2000 Total isolation 9800 11000 10200 Bacteria　A 　 2 　10 　 13
Totalは，その年の全ての分離された細菌数，Aは，増加している菌です。このようなケースには，chi square test trendを使用してもよろしいですか。それとも，fisher's exact testがよろしいでしょうか。教えていただけると，ものすごく助かります。

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300.　Re: chi square test trendの適応について　青木繁伸　　2003/07/10 (木) 09:35

Fisher's exact test は，Chi square test の正確な検定です。
Chi square trend test は Chi square test の検定統計量を trend とそれからの乖離に分解し，前者を用います。
当然ながら Chi square trend test のカイ二乗値は Chi square test より小さくなります。
カイ二乗統計量が小さいということは，P 値も小さくなります。
同じデータの検定ですから，P 値が小さいと言うことは検定力も高いと言うことです。

よって，Chi square trend test を行うのが適切です。

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307.　Re^2: chi square test trendの適応について　yoko　　2003/07/10 (木) 13:36

> Fisher's exact test は，Chi square test の正確な検定です。
すみません。投稿の仕方をあやまって，お返事自身を送ってしまいました。
ご指導ありがとうございました。
私は，細菌Aの観察期間における増加傾向に言及するために，
Chi square trend test を使用したのですが，1997年のAの検出数が2株と少なかったので，Fisher's exact testで1997年に対する各年に対する比率をcheckした後，Chi square trend test で検定したのです。でもくどすぎるかな，と悩んでいたのですが，Chi square trend test のみにします

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308.　Re^3: chi square test trendの適応について　青木繁伸　　2003/07/10 (木) 14:14

Chi square trend test の exact 版をやればよいのでしょうが，プログラムを書くのが面倒くさそうですね。

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