モノクローナル抗体のエピトープを相互競合試験によって分類しようとしています。
ある抗体を抗原と結合させるときに，別の抗体を存在させることで競合的な結合阻害を測定しました。具体的には30個の抗体がその30種の抗体から受ける競合の度合いを0-100%の値で表示したテーブルを持っていて（30x30），これを各抗体の競合パターンの類似度により，分類したいのです。ユークリッド距離を用いたクラスター分析で，まあまあの結果を得ました。さらにためしに各抗体の競合パターンの相関係数を計算してその数値に対して，クラスター分析を行なったところ，すばらしい分離度で各エピトープが分類されました。そこで，各抗体の競合パターンについてなんらかの類似度指標を計算してから，クラスター分析をしたいと思っているのですが，どのような類似度指標が妥当なのかわかりません。相関係数ではそのエピトープに属する抗体の多少により値が影響をうけてしまうので適当でないと思っています。素人で申し訳ありませんが，どのような解析が妥当かについて，ご示唆いただけないでしょうか?どうぞよろしくお願いいたします。 |