303 R -- コクラン・アーミテージ検定 青木繁伸 2002/01/18 (金) 22:39
303. R -- コクラン・アーミテージ検定 青木繁伸 2002/01/18 (金) 22:39 |
Cochran.Armitage <- function(n.i, r.i, x.i=F) { k <- length(n.i) n <- sum(n.i) r <- sum(r.i) p.i <- r.i/n.i p.m <- r/n if (x.i == F) { x.i <- 1:k } xx <- x.i-(x.m <- sum(n.i*x.i)/n) b <- sum(n.i*(p.i-p.m)*xx)/sum(n.i*xx^2) a <- p.m-b*x.m xt <- b^2*sum(n.i*xx^2)/(p.m*(1-p.m)) xh <- n^2*(sum(r.i^2/n.i)-r^2/n)/r/(n-r) xq <- xh-xt res <- matrix(c(xt, xq, xh, 1, k-2, k-1, 1-pchisq(xt,1), 1-pchisq(xq,k-2), 1-pchisq(xh,k-1)), nrow=3) colnames(res) <- c("Chi-sq.", "d.f.", "P") rownames(res) <- c("Trend", "Quad.", "Homo.") res } x.i <- c(10, 20, 30, 40, 50) n.i <- c(30, 35, 47,21, 45) r.i <- c(2, 4, 14, 13, 39) Cochran.Armitage(n.i, r.i, x.i) 結果 Chi-sq. d.f. P Trend 68.572732 1 1.110223e-16 Quad. 4.014484 3 2.599043e-01 Homo. 72.587216 4 6.439294e-15 |
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