抵抗直線 Last modified: Sep 03, 2009
目的
抵抗直線(resistant line)を描く。
使用法
resistant.line(x, y, no.iteration=FALSE, n=1)
# print メソッド
print.resistant.line(obj, digits=5, sig=0.95)
# plot メソッド
plot.resistant.line(obj, posx="topleft", posy=NULL, xlab=obj$names.xy[1], ylab=obj$names.xy[2], hist=FALSE, ...)
引数
x 独立変数
y 従属変数
no.iteration 繰り返し収束計算をしないときには TRUE を指定する
n ブートストラップ法で信頼区間を求めるときの回数
デフォルトは 1。この場合には信頼区間を求めない
obj "resistant.line" オブジェクト
digits 表示桁数
sig ブートストラップ法による信頼区間を求めるときの信頼度
posx, posy legend 関数のための位置引数("topleft", "bottomright" なども可)
xlab, ylab 軸の名前
hist ブートストラップ法の結果のヒストグラムを描くかどうか
... plot 関数に渡されるその他の引数
ソース
インストールは,以下の 1 行をコピーし,R コンソールにペーストする
source("http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/src/resistant_line.R", encoding="euc-jp")
# 抵抗直線を描く
resistant.line <- function( x, # 独立変数(横軸に取る)
y, # 従属変数(縦軸に取る)
no.iteration=FALSE, # 収束計算をするかどうか
n=1) # ブートストラップ法で信頼区間を求めるときの回数
{
resistant.line0 <- function(x, y)
{
OK <- complete.cases(x, y) # 欠損値を持つケースを除く
x <- x[OK]
y <- y[OK]
n <- length(x) # データの組数
o <- order(x) # x の順序づけ
x <- x[o] # x を昇順に並べ替える
y <- y[o] # x,y を対応づけて並べ替える
m <- floor(n/3) # データを 3 分割するときの個数
n1 <- 1:m # 最初の 1/3 に対する添え字
n2 <- (m+1): (n-m) # 次の 1/3 に対する添え字
n3 <- (n-m+1):n # 最後の 1/3 に対する添え字
m.x1 <- median(x[n1]) # 最初の 1/3 の中央値
m.x2 <- median(x[n2]) # 次の 1/3 の中央値
m.x3 <- median(x[n3]) # 最後の 1/3 の中央値
a <- b <- 0 # 傾きと切片の初期値
repeat { # 収束計算
m.y1 <- median(y[n1]) # 最初の 1/3 の中央値
m.y2 <- median(y[n2]) # 次の 1/3 の中央値
m.y3 <- median(y[n3]) # 最後の 1/3 の中央値
d.a <- (m.y3-m.y1)/(m.x3-m.x1) # 傾きの修正量
d.b <- (m.y1+m.y2+m.y3-d.a*(m.x1+m.x2+m.x3))/3 # 切片の修正量
a <- a+d.a # 傾きの修正
b <- b+d.b # 切片の修正
if (no.iteration || abs(d.a/a) < 1e-7) break # 収束計算をしない場合,収束した場合はループ脱出
y <- y-(d.a*x+d.b) # 抵抗直線で説明できる部分を取り除く
}
return(c(b, a)) # 結果を返す
}
Driver <- function(x, y) # ブートストラップ法のためのドライバー
{
n <- length(x)
suffix <- sample(n, n, replace=TRUE) # リサンプリング
return(resistant.line0(x[suffix], y[suffix])) # リサンプリングしたデータについてパラメータを推定
}
names.xy <- c(deparse(substitute(x)), deparse(substitute(y))) # 変数名を控えておく
ans <- list(coefficients=resistant.line0(x, y), # 引数に対してパラメータを推定する
names.xy=names.xy, x=x, y=y)
if (n > 1) {
ans2 <- replicate(n, Driver(x, y)) # ブートストラップを n 回実行
ans <- append(ans, list(intercepts=ans2[1,], slopes=ans2[2,]))
}
class(ans) <- "resistant.line" # print, plot メソッドのためにクラス名をつけておく
return(ans)
}
# print メソッド
print.resistant.line <- function( obj, # "resistant.line" オブジェクト
digits=5, # 表示桁数
sig=0.95) # 信頼度
{
if (length(obj) == 4) {
cat("Intercept:", round(obj$coefficients[1], digits),
" Slope:", round(obj$coefficients[2], digits), "\n")
}
else {
alpha <- (1-sig)/2
LCL <- c(quantile(obj$intercepts, alpha), quantile(obj$slopes, alpha))
UCL <- c(quantile(obj$intercepts, 1-alpha), quantile(obj$slopes, 1-alpha))
ans <- data.frame(obj$coefficients, LCL, UCL)
dimnames(ans) <- list(c("Intercept:", "Slope:"),
c("Estimate", paste(c(alpha, 1-alpha), "%", sep="")))
print(ans, digits=digits)
}
}
# plot メソッド
plot.resistant.line <- function(obj, # "resistant.line" オブジェクト
posx="topleft", posy=NULL, # legend 関数のための位置引数
xlab=obj$names.xy[1], ylab=obj$names.xy[2], # 軸の名前
hist=FALSE, # ヒストグラムを描くとき TRUE にする
...) # その他の任意の plot 関数の引数
{
if (hist && length(obj) == 6) { # ブートストラップの結果を,hist=TRUE のときに,ヒストグラムで表示する
layout(matrix(1:2, 2))
hist(obj$intercepts, xlab="Intercept", main="", right=FALSE)
hist(obj$slopes, xlab="Slope", main="", right=FALSE)
layout(1)
}
else { # 散布図と Deming 法の回帰直線と直線回帰式を表示する
plot(obj$x, obj$y, xlab=xlab, ylab=ylab, ...)
abline(obj$coefficients)
abline(lm(obj$y~obj$x), lty=2, col=2)
legend(posx, posy, legend=c("resistant line", "linear regression"), lty=1:2, col=1:2)
}
}
使用例
x <- 1961:1993
y <- c(139.130, 140.293, 143.137, 147.350, 150.686, 144.317, 151.207,
152.882, 156.867, 155.749, 157.735, 162.962, 159.036, 158.589, 149.213,
148.725, 161.331, 161.363, 158.899, 142.862, 139.085, 162.026, 162.117,
163.621, 152.982, 170.722, 162.175, 144.809, 167.581, 185.984, 176.457,
134.477, 134.477)
resistant.line(x, y)
resistant.line(x, y, n=1000)
出力結果例
> resistant.line(x, y) # 点推定値と信頼区間を求める
Intercept: -1189.844 Slope: 0.68187
> a <- resistant.line(x, y, n=1000) # 点推定値と信頼区間を求める
> print(a)
Estimate 0.025% 0.975%
Intercept: -1189.84415 -1940.14227 1029.1491 信頼区間は毎回異なる
Slope: 0.68187 -0.44554 1.0624
> plot(a) # 散布図と抵抗直線および回帰直線
> plot(a, hist=TRUE) # ブートストラップパラメータの分布図
> resistant.line(x, y) # 点推定値のみを求める
Intercept: -1189.844 Slope: 0.68187
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