以下の二方法のいずれかによって，作業ディレクトリを指定する。

1. メニューから指定する方法
   "Misc" メニュー（R 1.9.1 以前は "Tools" メニュー）から，"Change Working Directory..." を選択し，作業ディレクトリを選ぶ。
   （"Show Working Directory" によって，作業ディレクトリを確認できる。）
   

2. コマンドラインで指定する方法
   setwd によって，作業ディレクトリを設定する。
   getwd によって，作業ディレクトリを確認できる。

   > setwd("/Users/aoki/Desktop/r-working-dir") > getwd() [1] "/Users/aoki/Desktop/r-working-dir"